旷工一天扣三天工资的做法通常是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。

2. 合理性分析：

   • 旷工一天，劳动者仅当天未提供劳动，因此用人单位最多只能不支付当天的工资。扣除三天工资的做法超出了合理范围，明显侵犯了劳动者获取劳动报酬的权益。
   • 企业在制定规章制度时，应确保规定的合理性、公平性，并充分考虑到员工的权益。扣罚方式不应过分严厉，以至于构成对劳动者劳动报酬权利的侵犯。

3. 合法处理方式：

   • 对于劳动者的旷工行为，用人单位应当依据公司的规章制度或劳动合同约定进行处理，处理方式应当合法、合理、公正。
   • 合法的处理方式可以包括给予警告、记过、扣减绩效考核分数、扣减奖金等，但这些都不应违反国家法律法规的规定。

4. 劳动者权益保护：

   • 如果劳动者认为用人单位的处理方式不合法或不合理，可以与用人单位协商解决。
   • 协商不成的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，旷工一天扣三天工资的做法违反了《劳动法》及相关法规中关于不得无故克扣或拖欠劳动者工资的规定，因此通常是不合法的。用人单位在处理员工旷工问题时，应当遵循合法、合理、公正的原则，并尊重劳动者的合法权益。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。