商家缺货不能发货时，具体的赔偿金额需根据合同约定、法律规定及平台规则来确定。以下是对此问题的详细分析：

一. 合同违约责任与赔偿

1. 合同违约责任：消费者下单后，与商家之间即形成买卖合同关系。商家缺货不能发货，构成违约，应承担违约责任。根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，商家应承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

2. 赔偿范围：赔偿范围通常包括消费者因违约所遭受的实际损失，如交通费用、时间成本等（尽管这些损失的举证可能较为复杂，但法律上确实支持）。若商家行为构成欺诈，根据《中华人民共和国消费者权益保护法》，消费者有权要求增加赔偿至商品价款或服务费用的三倍，且最低不少于五百元。

二. 赔偿方式的确定

1. 按约定赔偿：若商家在商品页面或在与消费者的沟通中有关于缺货赔偿的明确承诺（如“缺货赔付订单金额的X%”），则商家应按照该约定进行赔偿。

2. 法定赔偿：在没有具体约定的情况下，商家应赔偿消费者因违约所遭受的实际损失。若构成欺诈，则适用上述《消费者权益保护法》中的惩罚性赔偿规定。

3. 平台规则赔偿：电商平台通常有针对商家缺货的管理规则和赔偿机制。例如，某些平台可能会要求商家支付订单金额的一定比例（如30%）作为违约金给消费者，但具体比例和限额可能因平台而异。这些违约金可能以平台优惠券、现金等形式发放。

三. 实际操作建议

• 与商家协商：首先尝试与商家沟通，了解其具体赔偿政策，并争取达成双方都能接受的解决方案。
• 查看平台规则：了解所购物平台的缺货赔偿规则，以便更准确地了解自己的权益。
• 保留证据：在处理此类问题时，务必保留好所有相关证据（如订单截图、聊天记录等），以便在需要时证明自己的权益。

综上所述，商家缺货不能发货时的具体赔偿金额需综合考虑合同约定、法律规定及平台规则。我建议消费者在与商家协商无果后，可依据相关法律法规和平台规则来维护自己的权益，并寻求相应的赔偿。如有进一步需要，您可以继续咨询我。