农村网格员协助村民做防水是否违法，这个问题首先需要明确几个关键点：网格员的职责范围、防水工作的性质以及法律法规的相关规定。

首先，网格员作为基层治理的重要力量，他们的主要职责是负责网格内的日常巡查、信息收集、问题上报以及协助解决村民的各类问题。从提供的参考信息中，我们可以看到网格员在协助调解水源纠纷、土地界限纠纷等方面发挥了积极作用，这些都是他们职责范围内的正常工作。

其次，防水工作通常指的是为了防止水侵入或渗透而采取的一系列措施。在农村环境中，防水可能涉及到农田灌溉、房屋防漏、水源保护等多个方面。如果防水工作是村民为了改善生产生活环境、保护财产而进行的合理行为，并且符合相关法律法规的规定，那么网格员协助村民进行防水工作是不违法的。

然而，也需要注意到，如果防水工作涉及到非法占用土地、破坏水资源、影响他人合法权益等违法行为，或者网格员在协助过程中超出了自己的职责范围，甚至参与了违法活动，那么这种行为就是违法的。

综上所述，农村网格员协助村民做防水本身并不违法，但前提是防水工作必须是合法、合理的，并且网格员的行为必须在其职责范围内进行。如果防水工作或网格员的行为涉及到违法行为，那么就需要依法承担相应的法律责任。因此，在具体情况下，需要综合考虑各种因素来判断网格员协助村民做防水是否违法。