工程结算审计总价高于招标中标价不一定违法，其合法性取决于具体情况及合同条款。以下是对此问题的详细分析：

一. 中标价与合同价的关系

• 根据《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例的相关规定，招标人和中标人应当依照招标投标法和本条例的规定签订书面合同，合同的标的、价款、质量、履行期限等主要条款应当与招标文件和中标人的投标文件的内容一致。这意味着，中标价与合同价在正常情况下应当是一致的。

二. 工程结算审计总价与合同价的关系

• 工程结算审计总价是工程结算时经过审计部门或机构审核后确定的价格。在理想情况下，工程结算审计总价应当与合同价保持一致。
• 然而，在实际操作过程中，由于工程变更、材料价格波动、政策调整等因素，工程结算审计总价可能会高于或低于合同价。

三. 工程结算审计总价高于招标中标价的具体分析

1. 合法情况：

   • 如果工程结算审计总价高于招标中标价是由于工程变更、材料价格波动等合理因素导致的，且这种变更经过了双方协商一致并签订了补充协议，那么这种情况并不违规。
   • 例如，某项工程因设计变更导致实际施工成本增加，双方通过协商签订了补充协议，对增加的成本进行了确认和处理，此时工程结算审计总价高于招标中标价是合法的。

2. 违法情况：

   • 如果工程结算审计总价高于招标中标价是由于招标人或中标人单方面违反合同约定或招标投标法的相关规定，例如通过恶意串通、弄虚作假等手段提高工程价款，那么这种情况就属于违规行为。
   • 例如，某施工单位在投标时故意压低报价以中标，随后在施工过程中通过虚增工程量、提高材料价格等手段提高工程价款，导致工程结算审计总价高于招标中标价，这种行为是违法的。

四. 案例分析

• 案例背景：某市中学工程标底价1378.62万元，中标金额1110.21万元，下浮率为19.47%。施工单位送审造价为1879.39万元，经审计后核定结算价为1791.88万元，结算价超合同价681.67万元。

• 案例分析：

  • 该案例中，结算价远超合同价，其中涉及人工费调整、材料价补差、工程量清单误差复核、工期延误补偿费、设计变更增加造价等多个因素。
  • 如果这些因素均是由于合理的工程变更和双方协商一致导致的，并且已经签订了补充协议进行确认和处理，那么这种情况并不违规。
  • 如果其中存在恶意串通、弄虚作假等违规行为，那么施工单位将承担相应的法律责任。

我的观点：工程结算审计总价高于招标中标价并不必然意味着违法，其合法性需要根据具体情况和合同条款来判断。在处理此类问题时，建议双方充分沟通协商，必要时可寻求法律专业人士的帮助以确保自身权益得到保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。