不会，招商银行卡重新办理后，不会自动扣款美团逾期款项。下面我对此进行详细分析：

一. 银行卡与自动扣款的关系

1. 银行卡的重新办理，通常意味着原卡片的注销和新卡片的开立。新卡片与原卡片在账户信息、卡号等方面都是独立的。
2. 自动扣款通常基于持卡人之前与商户（如美团）签订的代扣协议，该协议绑定的是特定的银行卡卡号。

二. 代扣协议的效力

1. 当原银行卡注销后，与之相关的代扣协议也随之失效。新银行卡开立时，并不会自动继承原银行卡的代扣协议。
2. 因此，除非持卡人明确与新银行卡签订代扣协议，否则美团无法从新银行卡中自动扣款。

三. 逾期款项的处理

1. 如果美团存在逾期款项未还，持卡人需要主动与美团沟通还款事宜，或者通过美团提供的还款渠道进行还款。
2. 银行卡的重新办理并不会影响逾期款项的还款责任，持卡人仍需承担相应的还款义务。

综上所述，招商银行卡重新办理后，不会自动扣款美团逾期款项。我建议您主动与美团沟通还款事宜，确保逾期款项得到妥善处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。