把商家的货扔掉然后申请仅退款是不合法的。

一. 分析货物处理与退款的关系

1. 货物是商家的财产：当你购买商品并收到货后，这些商品在未经商家同意的情况下，仍然是商家的财产。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将代为保管的他人财物非法占为己有，且数额较大、拒不退还的，可能构成侵占罪。
2. 扔掉货物构成非法处置：如果你把商家的货物扔掉，这实际上是对商家财产的非法处置。这种行为不仅违反了商家与你的合同关系（即购买合同），也可能触犯刑法中的侵占罪。

二. 结合消费者权益保护法的规定

1. 退货与退款的规定：根据《中华人民共和国消费者权益保护法》，如果商品不符合质量要求，你有权要求退货或退款。但这一权利的前提是商品仍然存在，且你需要将商品退还给商家。
2. 无理由退货的限制：即使是无理由退货，也要求你退回的商品应当完好。如果你已经扔掉了商品，那么就无法满足这一条件。

三. 总结与建议

• 不合法且不合理：把商家的货扔掉然后申请仅退款，既违反了法律规定，也违背了商业道德和诚信原则。
• 正确的做法：如果商品有问题，你应该与商家协商退货或退款事宜，并按照商家的要求将商品退回。
• 法律责任：如果商家因此遭受损失，你可能需要承担法律责任，包括赔偿商家的损失。

我建议你与商家沟通，说明情况，并按照商家的要求处理退货事宜。如果商家坚持要求你退货而你已经无法退回商品，那么你可能需要与商家协商其他解决方案，如支付部分货款作为补偿。如有进一步需要，您可以继续咨询我。