一般情况下，事业单位不会追究员工2012年9月之前的吸毒记录和不起诉记录。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 法律层面的考量：

   • 吸毒记录通常属于个人隐私范畴，除非涉及特定的法律程序（如刑事调查、入职背景调查等），否则一般不会被公开或追究。
   • 不起诉记录意味着检察机关经过审查后认为没有起诉的必要，或者证据不足，这通常也不会对个人的后续生活产生持续性的负面影响。

2. 事业单位的管理规定：

   • 事业单位在招聘或管理员工时，通常会遵循一定的规定和程序。这些规定往往关注员工的当前状态和表现，而不是过去的记录。
   • 当然，如果事业单位的特定岗位有特别的安全或道德要求，可能会进行更为严格的背景调查，但这通常会有明确的法律规定或政策依据。

3. 时间因素：

   • 2012年9月之前的记录距离现在已经有相当长的时间。在这段时间里，个人可能已经发生了很大的变化。
   • 事业单位在评估员工时，通常会更注重近期的表现和行为。

4. 实际操作的可行性：

   • 事业单位要获取员工过去的吸毒记录或不起诉记录，通常需要经过一定的法律程序，这并不是一件容易的事情。
   • 而且，即使获取了这些记录，事业单位也需要根据具体情况来判断是否会对员工的当前工作产生实质性的影响。

综上所述，从法律层面、事业单位的管理规定、时间因素以及实际操作的可行性来看，事业单位一般不会追究员工2012年9月之前的吸毒记录和不起诉记录。当然，如果员工担心这个问题，可以向事业单位的人事部门或法律顾问咨询，以获得更具体的解答和建议。