挂靠和以特殊工种注册到公司确实存在区别。以下是对这两者的详细分析：

一. 定义与性质

1. 挂靠：通常指的是个人与某个单位达成某种协议，以该单位的名义从事某项活动或工作，但实际上并不在该单位全职工作或并不具备该单位所要求的资质。挂靠更多是一种形式上的关联，而非实质上的雇佣或合作。

2. 以特殊工种注册到公司：这指的是个人以特定工种或专业技能的身份，正式注册成为公司的一员。这种情况下，个人与公司之间存在明确的雇佣关系，且个人通常具备该工种所需的专业技能和资质。

二. 法律后果与风险

1. 挂靠：

   • 法律风险较高，因为挂靠往往涉及虚假申报、资质不符等问题，可能违反相关法律法规。
   • 在发生纠纷或事故时，挂靠关系可能难以得到法律的有效保护，个人可能面临较大的法律责任和经济损失。

2. 以特殊工种注册到公司：

   • 法律关系明确，个人与公司之间的权利义务关系受劳动法等相关法律法规保护。
   • 在工作过程中发生纠纷或事故时，个人可以依法维护自己的权益，公司也需承担相应的法律责任。

三. 实际运作与权益

1. 挂靠：

   • 个人通常不享受公司提供的完整福利待遇，如社保、医保等。
   • 挂靠关系可能较为松散，个人在公司中的地位和权益保障较弱。

2. 以特殊工种注册到公司：

   • 个人作为公司正式员工，享受公司提供的完整福利待遇。
   • 在公司中有明确的职位和职责，权益得到较好保障。

综上所述，挂靠和以特殊工种注册到公司在定义、性质、法律后果与风险以及实际运作与权益等方面均存在明显区别。我建议个人在选择时，应充分考虑自己的实际情况和需求，以及相关的法律风险和后果，做出明智的选择。如有进一步需要，您可以继续咨询我。