关于路面取芯厚度不合格监督站如何处罚的问题，这通常涉及到具体的交通工程质量监管规定和相关的法律法规。以下是一个基于您提供的参考信息以及一般行业实践的详细解答：
首先，当监督站发现路面取芯厚度不合格时，他们会立即进行进一步的调查以确认问题的严重性、影响范围以及可能的原因。这通常包括现场勘查、收集证据、与施工单位沟通等步骤。
一旦确认存在质量问题，监督站会根据相关的法律法规和监管规定，对施工单位采取相应的处罚措施。这些措施可能包括但不限于：
行政处罚：根据违规的严重程度，监督站可能会对施工单位进行罚款、警告、责令停工整改等行政处罚。罚款的金额可能会根据工程造价的一定比例来确定，如您提供的参考信息中提到的“可以并处工程造价百分之二以下的罚款”。
信用记录：施工单位的不良行为可能会被记录在案，影响其未来的信用评级和参与其他工程项目的资格。
法律诉讼：如果质量问题导致了严重的后果，如交通事故或财产损失，监督站可能会将案件移送司法机关，追究施工单位的法律责任。
纠正措施：除了处罚外，监督站还会要求施工单位采取必要的纠正措施，以确保工程质量符合设计要求。这可能包括重新施工、加固处理或其他补救措施。
在处理此类问题时，监督站通常会秉持公正、公平、公开的原则，确保处罚措施的合理性和有效性。同时，他们也会积极与施工单位沟通，提供必要的指导和帮助，以促进问题的及时解决。
总的来说，路面取芯厚度不合格是一个严重的质量问题，需要得到及时有效的处理。监督站将依据相关法律法规和监管规定，对施工单位采取相应的处罚措施，并确保问题得到妥善解决。