股东在减资过程中，如果工商局不办理相关手续，股东可以起诉工商局。以下是对此问题的详细分析：
一. 法律依据
《中华人民共和国行政诉讼法》第二条：公民、法人或者其他组织认为行政机关和行政机关工作人员的行政行为侵犯其合法权益，有权依照本法向人民法院提起诉讼。股东作为法人，认为工商局的行政行为（不办理减资手续）侵犯了其合法权益，因此有权提起诉讼。
《中华人民共和国公司法》第一百七十七条：公司需要减少注册资本时，必须编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出减少注册资本决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，有权要求公司清偿债务或者提供相应的担保。公司减资后的注册资本不得低于法定的最低限额。此条款说明了公司减资的法定程序，但并未直接规定工商局必须办理减资手续。然而，如果工商局无故拒绝办理，则可能构成对股东合法权益的侵犯，股东可以依据《行政诉讼法》提起诉讼。
二. 分析说明
股东权益受损：股东按照公司法规定的程序进行减资，并提交了所有必要的文件，但工商局无故不办理减资手续，这直接导致了股东的合法权益受损。
行政行为的合法性：工商局作为行政机关，其行政行为应当遵循合法、合理、公正等原则。如果工商局没有合理的理由拒绝办理减资手续，那么其行政行为可能构成违法。
诉讼的合理性：股东在穷尽其他救济途径（如行政复议）后，仍无法得到满意的结果，那么向法院提起诉讼是合理的选择。通过诉讼，股东可以请求法院对工商局的行政行为进行审查，并要求工商局履行其法定职责。
三. 结论与建议
综上所述，股东在减资过程中，如果工商局无故不办理相关手续，股东确实有权起诉工商局。我建议股东在提起诉讼前，先尝试与工商局进行沟通，了解其拒绝办理的具体原因，并尝试通过行政复议等方式解决争议。如果无法解决，再向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。