对政府信息公开权限另有规定的情形，主要依据相关法律法规的特别规定来处理。详细分析如下：

1. 特别法规定：

   • 根据《中华人民共和国政府信息公开条例》第十一条的规定，除了该条例明确列举的不予公开的政府信息外，还存在“其他法律、行政法规明确规定不予公开的政府信息”这一情形。这意味着，如果有其他法律、行政法规对特定政府信息的公开有特别规定，并明确为不予公开的，那么这些信息应按照相关规定处理，而不受《政府信息公开条例》一般规定的约束。

2. 实例说明：

   • 例如，某部法律可能规定，涉及特定国家安全事项的信息，即使不在《政府信息公开条例》明确列举的不予公开范围内，也因其特殊性而被该法律明确规定为不予公开。在这种情况下，行政机关就应当依据该法律的特别规定，对这类信息不予公开。

我建议，在处理政府信息公开问题时，除了遵循《政府信息公开条例》的一般规定外，还应特别注意是否有其他法律、行政法规对特定信息的公开有特别规定。如有特别规定，应优先遵循这些特别规定来处理政府信息的公开问题。如有进一步需要，您可以继续咨询我。