关于“项目质保金是否由物业公司扣除”的问题，首先我们需要明确项目质保金的性质及其与物业公司的关系。

结论前置：项目质保金通常不是由物业公司直接扣除的，而是由建设单位（或开发商）按照相关规定或合同约定，在工程项目竣工验收后，从应付的工程款中预留的一部分资金，用作工程质量的保证。

详细分析：

1. 项目质保金的性质：

   • 项目质保金是工程项目竣工验收后，为确保工程质量而预留的一部分资金。
   • 其目的是在保修期内，若工程出现质量问题，能够有足够的资金进行维修或赔偿。

2. 物业公司的角色：

   • 物业公司主要负责小区的物业管理、服务及日常维护等工作。
   • 物业公司通常不直接参与工程项目的建设，也不是项目质保金的扣留或管理主体。

3. 质保金的扣留与管理：

   • 质保金一般由建设单位（或开发商）在工程项目竣工验收后，按照相关规定或合同约定进行扣留。
   • 扣留的质保金会存放在指定的账户，并由建设单位（或开发商）负责管理，直至保修期满且无质量问题后，再按照合同约定进行退还。

4. 特殊情况：

   • 在某些情况下，物业公司可能会代建设单位（或开发商）收取或管理质保金，但这通常是在特定的合同约定或委托关系下进行的。
   • 即使物业公司代管质保金，其也仅是代为履行管理职责，并不拥有质保金的所有权或处置权。

综上所述，项目质保金通常不是由物业公司直接扣除的，而是由建设单位（或开发商）按照相关规定或合同约定进行扣留和管理。若您对具体的质保金扣留或管理情况有疑问，建议直接咨询相关的建设单位（或开发商）或查阅相关的合同约定。