破坏小区公共水系进行改造是违法的。具体分析如下：

首先，从法律角度来看，小区公共水系属于小区业主共有部分，受《中华人民共和国民法典》等法律法规的保护。任何单位或个人未经法定程序，不得擅自改变其用途或进行改造。

其次，破坏小区公共水系进行改造，可能会损害小区业主的共同利益，破坏小区的整体环境和景观。这种行为不仅违反了法律法规，也违背了小区业主的共同意愿和利益。

最后，如果发现有破坏小区公共水系进行改造的行为，小区业主或相关利害关系人可以依法向有关部门投诉或举报，要求相关部门依法处理。同时，也可以咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益。

因此，我强烈建议大家在涉及小区公共部分改造等问题时，应遵守相关法律法规，尊重小区业主的共同意愿和利益，通过合法途径进行协商和处理。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。