对于男方离家5年不知去向，女方起诉离婚时法院管辖的问题，结论如下：

女方可以向男方最后居住地或户籍所在地的人民法院提起离婚诉讼。若男方离开住所地超过1年，女方可以向自己的住所地或经常居住地的人民法院提起离婚诉讼。

分析说明：

1. 一般管辖原则：

   • 根据《民事诉讼法》的相关规定，离婚诉讼通常由被告（即男方）住所地人民法院管辖。住所地是指被告的户籍所在地。

2. 特别管辖情况：

   • 若男方离开住所地超过1年，且女方无法确定其具体去向，女方可以向自己的住所地或经常居住地的人民法院提起离婚诉讼。这是为了保护女方的合法权益，避免因其无法找到男方而无法提起离婚诉讼。

3. 管辖法院的确定：

   • 在确定管辖法院时，女方应首先尝试确定男方的最后居住地或户籍所在地。若男方最后居住地与户籍所在地不一致，女方可以选择向其中一地的人民法院提起离婚诉讼。
   • 若男方离开住所地超过1年，且女方无法确定其去向，女方则应向自己的住所地或经常居住地的人民法院提起离婚诉讼。

4. 起诉材料的准备：

   • 在提起离婚诉讼时，女方应准备相应的起诉材料，包括起诉状、结婚证、身份证等证件的复印件，以及证明男方离家不知去向的相关证据材料。

综上所述，女方在男方离家5年不知去向的情况下，可以向男方最后居住地或户籍所在地的人民法院提起离婚诉讼。若男方离开住所地超过1年，女方也可以向自己的住所地或经常居住地的人民法院提起离婚诉讼。在提起离婚诉讼时，女方应准备相应的起诉材料，并尽量提供证明男方离家不知去向的相关证据。