针对您提出的“员工有自己公司赚了钱怎么办”的问题，这主要涉及到员工兼职、竞业禁止、公司利益冲突以及可能的税务问题等多个方面。以下是我根据不同情况给出的分析：

1. 员工兼职与竞业禁止：

   • 首先，需要查看员工与公司之间签订的劳动合同或相关协议中，是否有关于兼职或竞业禁止的条款。
   • 如果合同中明确禁止员工从事与公司业务相竞争的活动，或者对员工兼职有严格限制，那么员工自己开公司并赚钱可能违反了合同约定。
   • 在这种情况下，公司有权根据合同规定采取相应措施，包括但不限于要求员工停止兼职、赔偿损失等。

2. 公司利益冲突：

   • 员工自己开公司可能会与公司产生利益冲突，特别是当员工利用公司资源、客户信息或商业秘密为自己谋利时。
   • 公司应密切关注员工的兼职行为是否对公司造成了实际或潜在的损害，并采取必要措施保护公司利益。

3. 税务问题：

   • 员工从自己公司获得的收入需要依法纳税，包括个人所得税和企业所得税等。
   • 如果员工未按规定申报纳税或存在偷税漏税行为，将面临税务部门的处罚。

4. 建议与措施：

   • 公司应完善劳动合同和相关管理制度，明确员工兼职和竞业禁止的规定。
   • 加强对员工兼职行为的监管，及时发现并处理违规行为。
   • 员工在兼职前应与公司进行充分沟通，确保自己的行为不违反公司规定和法律法规。
   • 对于涉及的税务问题，建议员工咨询专业税务机构或税务师进行合规处理。

综上所述，员工有自己公司并赚钱的情况需要综合考虑多个方面，包括合同约束、公司利益、税务合规等。如果您或您所在公司面临类似问题，建议及时咨询专业律师进行详细分析和指导。