商店缺货赔偿主要取决于商家与消费者之间的约定以及相关法律法规的规定。

一. 合同约定优先

1. 商家承诺：如果商家在销售过程中明确承诺了某种商品的供应，并且因为缺货导致无法履行该承诺，那么商家应当根据合同约定承担相应的赔偿责任。这种赔偿可能包括退还已支付的款项、提供替代商品或者支付一定的违约金等。

• 例如，商家在宣传中明确表示“保证有货”，但消费者下单后却被告知缺货，此时商家应依据合同约定进行赔偿。

二. 法律法规规定

1. 消费者权益保护法：根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，经营者应当以诚信原则经营，不得进行虚假宣传或误导消费者。如果商家因为缺货而无法履行与消费者的约定，且存在虚假宣传或误导行为，那么消费者有权要求商家承担相应的法律责任，包括但不限于赔偿损失。
2. 违约责任：如果商家与消费者之间形成了有效的买卖合同关系，但商家因为缺货而无法交付商品，那么商家就构成了违约。在这种情况下，消费者可以要求商家承担违约责任，包括赔偿因此造成的损失。

三. 实际赔偿操作

1. 协商赔偿：在发生缺货赔偿纠纷时，消费者首先可以与商家进行协商，尝试达成赔偿协议。双方可以根据合同约定、法律法规以及实际情况来协商具体的赔偿方式和金额。
2. 投诉举报：如果协商无果，消费者可以向相关监管部门或消费者协会进行投诉举报，寻求帮助和支持。这些机构通常会介入调查，并根据调查结果给出相应的处理意见。

我建议，在购物过程中，消费者应当保留好相关的购物凭证（如订单信息、聊天记录等），以便在发生纠纷时作为证据使用。同时，商家也应当诚信经营，确保商品供应的充足和稳定，以避免因缺货而引发的赔偿纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。