违约金不应直接写在发票上。下面是对这一问题的详细分析：

一. 违约金与发票的性质

1. 违约金的性质：违约金是合同双方约定，在一方违约时向另一方支付的一定数额的金钱，作为对违约行为的惩罚或补偿。它属于合同履行的附属义务，并非交易的主要内容。
2. 发票的性质：发票是交易双方进行商品或劳务交易时，由销售方或提供服务方开具给购买方或接受服务方的凭证。它主要记录交易的内容、数量、金额等信息，是财务和税务管理的重要依据。

二. 违约金不应写入发票的原因

1. 不符合发票开具规定：根据发票管理的相关规定，发票应真实、准确地反映交易的内容、数量和金额。而违约金并非交易的主要内容，也不属于交易的实际金额，因此不应写入发票。
2. 可能导致税务风险：将违约金写入发票可能导致税务部门对交易的真实性和合法性产生质疑，从而引发税务风险。同时，违约金通常不涉及增值税等税费的计算，将其写入发票可能导致税费计算错误。

三. 违约金的正确处理方式

1. 单独开具收据或证明：对于违约金的支付，可以单独开具收据或证明，明确记载违约金的金额、支付时间、支付方式等信息，作为双方结算和账务处理的依据。
2. 在合同中明确约定：为确保违约金的合法性和有效性，建议在合同中明确约定违约金的数额、支付方式、支付时间等条款，以便在发生违约时能够有据可依。

我建议，在处理违约金时，应严格遵守相关法律法规和财务管理规定，确保交易的合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。