在自己承包的林地发现磷矿，不能直接开采，而应依法向自然资源主管部门申请采矿许可证，并按规定程序进行开采。以下是对此问题的详细分析：

一. 矿产资源属于国家所有

• 根据《中华人民共和国矿产资源法》第三条，矿产资源属于国家所有，由国务院行使国家对矿产资源的所有权。地表或者地下的矿产资源的国家所有权，不因其所依附的土地的所有权或者使用权的不同而改变。因此，您承包的林地下的磷矿，其所有权依然属于国家，您不能因拥有林地的承包经营权而自动获得磷矿的开采权。

二. 擅自开采矿产资源属于违法行为

• 违反矿产资源法：根据《中华人民共和国刑法》第三百四十三条，违反矿产资源法的规定，未取得采矿许可证擅自采矿，情节严重的，将受到刑事处罚。这包括擅自开采如磷矿等国家规定的特定矿种。
• 改变土地用途：承包的林地属于农用地，未经批准在其上开采矿产资源，属于擅自改变土地用途的行为，可能触犯《中华人民共和国刑法》第三百四十二条关于非法占用农用地罪的规定。

三. 合法开采矿产资源的程序

1. 申请探矿权：对于大部分矿种，包括磷矿，首先需要申请矿产资源勘查许可证（探矿权证）。经过不同阶段的勘查工作，取得一定的资源量和储量后，方可进入下一步。
2. 申请采矿许可证：在达到申请采矿许可证的其他要求后，您可以向自然资源主管部门申请采矿许可证。根据矿产种类的不同，有些矿种可能允许直接申请采矿许可证，但磷矿通常需要先申请探矿权。
3. 遵守开采规定：在取得采矿许可证后，您必须在许可证批准的范围内进行开采，并遵守相关的矿产资源保护和合理利用规定。

四. 实际操作中的建议

• 咨询专业人士：由于矿产资源开采涉及复杂的法律程序和技术要求，我建议您咨询专业的矿产资源法律顾问或机构，以获取更具体和针对性的建议。
• 了解当地政策：不同地区的矿产资源管理政策可能有所不同，您还需要了解并遵守当地的相关规定。
• 合法合规经营：在申请和开采过程中，务必确保所有行为都符合法律法规的要求，以避免不必要的法律风险。

总结：发现承包林地下的磷矿后，您不能直接开采。而应依法向自然资源主管部门申请探矿权和采矿许可证，并按规定程序进行开采。同时，务必遵守相关的法律法规和当地政策，确保合法合规经营。如有进一步需要，您可以继续咨询我。