刑事诉讼法查清事实主要包括立案、侦查和审查起诉三个步骤。下面我将详细解释这三个步骤：
一. 立案
- 立案的概念和意义：立案是刑事诉讼程序的开始，也是刑事诉讼的必经程序。只有经过立案，其他诉讼阶段才能依次进行，公安司法机关进行侦查、起诉、审判活动才有了法律依据，才能产生法律效力。
- 立案的材料来源：立案的材料来源主要包括公安机关或者人民检察院自行发现的犯罪事实或者犯罪嫌疑人，以及单位和个人报案或者举报的犯罪事实或犯罪嫌疑人，还包括被害人报案或者控告的犯罪事实或犯罪嫌疑人，以及犯罪嫌疑人自首的案件。
二. 侦查
- 侦查的概念：侦查是公安机关、人民检察院对于案件，依照法律进行的收集证据、查明案情的工作和有关的强制性措施。
- 侦查的内容：侦查阶段主要任务是通过各种侦查手段查清案件事实，包括讯问犯罪嫌疑人、询问证人、勘验、检查、搜查、扣押物证、书证、鉴定、通缉、侦查实验、辨认、侦查终结等工作。
- 侦查的终结：侦查终结后，应当写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定。
三. 审查起诉
- 审查起诉的概念：审查起诉是指人民检察院对公安机关移送起诉的案件，进行审查决定是否起诉的活动。
- 审查起诉的内容：人民检察院在审查起诉阶段，主要任务是审阅案卷材料，讯问犯罪嫌疑人，听取被害人和犯罪嫌疑人、被害人委托的人的意见，补充收集证据，对案件进行补充侦查等工作。
- 审查起诉的结果：人民检察院经过审查起诉，如果认为案件事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉，并将案卷材料、证据移送人民法院。
综上所述，刑事诉讼法查清事实的三个步骤是立案、侦查和审查起诉。这三个步骤相互衔接，共同构成了刑事诉讼程序的重要组成部分，确保了案件能够得到公正、准确的处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。