如果犯罪事实清楚且证据确实充分，公安机关应当写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定。以下是详细分析：

一. 犯罪事实清楚，证据确实充分的法律要求

• 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百六十二条，公安机关侦查终结的案件，必须做到犯罪事实清楚，证据确实、充分。这是法律对公安机关侦查工作的基本要求，也是确保案件质量的重要保障。

二. 公安机关的后续操作

• 在犯罪事实清楚，证据确实充分的情况下，公安机关应当写出起诉意见书。这份意见书是对案件侦查工作的总结，也是向人民检察院提出起诉建议的正式文件。
• 公安机关需要将起诉意见书连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定。这是公安机关将案件移送给人民检察院进行下一步诉讼程序的重要环节。

三. 犯罪嫌疑人的权利保障

• 在移送案件的同时，公安机关还应当将案件移送情况告知犯罪嫌疑人及其辩护律师。这是保障犯罪嫌疑人知情权和辩护权的重要举措，也是确保诉讼程序公正性的必要环节。

四. 特殊情况的处理

• 如果犯罪嫌疑人自愿认罪，公安机关应当记录在案，并随案移送，同时在起诉意见书中写明有关情况。这有助于人民检察院和人民法院更好地了解案件情况和犯罪嫌疑人的认罪态度。

综上所述，在犯罪事实清楚且证据确实充分的情况下，公安机关应当按照法律规定写出起诉意见书，并将案件移送人民检察院审查决定。这是确保案件得到公正处理的重要保障。如有进一步需要，您可以继续咨询我。