供应链有限公司可以入股外地农村的合作社，且二者可以是同一个法人。具体分析如下：

一. 供应链有限公司入股外地农村合作社的合法性

1. 根据《中华人民共和国农民专业合作社法》的相关规定，农民专业合作社是以农村家庭承包经营为基础，通过提供农产品的销售、加工、运输、贮藏以及与农业生产经营有关的技术、信息等服务来实现成员互助目的的组织。该法并未限制供应链有限公司作为法人或组织入股农村合作社。
2. 从商业实践角度，供应链有限公司入股外地农村合作社，可以实现资源共享、优势互补，有助于提升合作社的运营效率和市场竞争力。

二. 供应链有限公司与合作社法人同一性的可能性

1. 法人资格独立性：供应链有限公司和合作社都是具有独立法人资格的组织。但是，这并不妨碍同一个自然人或法人实体同时成为这两个组织的法人代表或股东。
2. 法规未禁止：我国现行法律法规并未明确禁止同一个法人同时担任供应链有限公司和合作社的法人代表或股东。因此，从法律层面讲，这是被允许的。

三. 实际操作中的注意事项

• 合规性审查：在入股或担任法人代表前，应进行充分的合规性审查，确保操作符合相关法律法规的要求。
• 避免关联交易风险：如果供应链有限公司与合作社之间存在关联交易，应确保交易的公平、公正，避免损害其他股东或成员的利益。
• 财务管理与透明度：应建立健全的财务管理制度，确保财务信息的透明度和准确性，以维护所有股东或成员的合法权益。

我的观点：供应链有限公司入股外地农村合作社是合法的，且二者可以是同一个法人。但在实际操作中，应确保合规性，并避免潜在的关联交易风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。