商家在饿了么平台因缺货导致无法发货，赔付的违约金数额应根据双方约定或法律规定来确定。具体分析如下：

一. 违约金数额的确定方式

1. 依据双方约定：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。因此，如果商家和消费者在饿了么平台上有明确的违约金约定，如缺货时赔付特定金额的违约金，那么赔付数额就应按照这一约定来执行。
2. 依据法律规定：如果双方没有明确的违约金约定，或者约定的违约金数额不合理（如过低或过高），那么可以根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，由人民法院或者仲裁机构根据当事人的请求，对违约金数额进行适当调整，以使其更加符合实际损失情况。

二. 实际损失与违约金的关系

• 约定的违约金应与实际损失相符。如果约定的违约金低于实际造成的损失，消费者有权请求人民法院或仲裁机构增加违约金数额；反之，如果约定的违约金过分高于实际造成的损失，商家也有权请求人民法院或仲裁机构适当减少违约金数额。

三. 违约金的支付与债务履行

• 根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，即使商家支付了违约金，如果消费者仍然要求商家履行发货义务（在缺货情况解决后），商家还应当继续履行这一债务。

我的观点：在饿了么平台上，商家因缺货导致无法发货时，赔付的违约金数额应首先依据双方约定来确定。如果没有约定或约定不合理，可以依据法律规定由人民法院或仲裁机构进行调整。同时，商家支付违约金后，在条件允许的情况下，仍应继续履行发货义务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。