在羁押了97天后，如果检察院发现证据不足，是有可能会变更强制措施的。具体分析如下：

1. 法律规定与通常做法：

   • 根据相关法律规定，当羁押期限届满且案件未办结时，若证据不足无法认定犯罪嫌疑人构成犯罪，通常会变更强制措施。这包括但不限于释放犯罪嫌疑人，或者采取取保候审、监视居住等非羁押性措施，以保障其合法权益，并方便后续进一步侦查及补充证据。

2. 侦查阶段的情况：

   • 在侦查阶段，如果羁押期满且证据不足，公安机关一般会考虑变更强制措施，如释放犯罪嫌疑人或采取其他非羁押性措施。这是为了避免超期羁押，同时确保后续侦查工作的顺利进行。

3. 审查起诉阶段的情况：

   • 当案件进入审查起诉阶段，如果检察院发现证据不足，它可能会作出不起诉决定。在这种情况下，犯罪嫌疑人会被释放。检察院在作出这一决定时，会综合考虑案件的证据情况、犯罪嫌疑人的社会危险性以及是否有继续侦查的必要。

4. 审判阶段的情况：

   • 如果案件已经进入到审判阶段，并且法院在审理过程中发现证据不足，无法认定被告人构成犯罪，那么法院应当作出证据不足、指控犯罪不能成立的无罪判决。此时，被告人也会被释放。

综上所述，羁押了97天后，如果检察院发现证据不足，它是有可能会根据案件的具体情况和相关法律规定，变更强制措施的。这既符合法律程序的要求，也体现了对犯罪嫌疑人合法权益的保障。如果你或你的亲友面临类似情况，建议尽快咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。