持票人不可以将多张承兑汇票合并在一个案件中提起诉讼。下面我详细解释一下这个结论：

首先，从法律的角度来看，每张承兑汇票都代表着一个独立的法律关系，它们各自有着独立的票据当事人、票据金额、到期日等要素。因此，持票人在行使票据权利时，需要针对每张汇票分别进行。

其次，从诉讼的角度来看，多张承兑汇票所涉的票据纠纷实际上是多个独立的诉。这些诉之间并不存在牵连关系，也不属于必要共同诉讼需要合并审理的情形。因此，持票人应当以一张票据为一个案件，向有管辖权的人民法院分别提起诉讼。

综上所述，持票人不可以将多张承兑汇票合并在一个案件中提起诉讼，而应当针对每张汇票分别进行起诉。这样做既符合法律的规定，也有利于法院对案件的审理和判决。如果你在这方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。