厂里上班时吃饭休息时间扣除是不正常的。下面我来详细解释一下：

首先，根据《劳动法》的相关规定，劳动者享有休息的权利，这是劳动者的基本权益之一。在工作时间内，劳动者应当享有合理的休息时间，包括吃饭时间、短暂的休憩时间等，这些时间应当计入工作时间之内，而不应当被扣除。

其次，从实际操作的角度来看，吃饭和休息是劳动者为了保持身体健康和工作效率所必需的。如果将这些时间扣除，不仅会影响劳动者的身体健康，还可能降低工作效率，对企业和劳动者双方都不利。

因此，厂里上班时吃饭休息时间被扣除是不符合劳动法规定的，也是不合理的。如果劳动者遇到这种情况，可以向企业提出异议，要求保障自己的合法权益。如果企业不予理睬，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，寻求法律援助和保护。

总之，吃饭休息时间作为劳动者的工作时间组成部分，不应当被扣除。劳动者应当积极维护自己的合法权益，确保在工作时间内享有合理的休息时间。