非法经营同类营业罪中的非法利益，通常是通过计算行为人因非法经营同类营业所获得的全部收入，扣除其直接用于经营活动的合理支出后得出的净收入部分来认定。具体分析如下：

一. 非法利益的认定方式

• 非法利益是指行为人通过非法经营同类营业所获取的不正当收益。在认定非法利益时，应综合考虑行为人的全部收入和支出情况。
• 收入部分应包括行为人因非法经营同类营业所获得的全部货币、实物、有价证券等形式的收益。
• 支出部分则应扣除行为人直接用于经营活动的合理成本，如购买原材料、支付员工工资等直接费用。
• 非法利益即为收入部分减去支出部分后的净收入。

二. 法律依据

• 根据《中华人民共和国刑法》第一百六十五条的规定，国有公司、企业的董事、经理利用职务便利，自己经营或者为他人经营与其所任职公司、企业同类的营业，获取非法利益，数额巨大的，将受到刑事处罚。
• 此处的“非法利益”即是指行为人通过非法经营同类营业所获得的净收入部分。

三. 实际案例中的应用

• 在实际案例中，司法机关会通过对行为人的财务记录、交易凭证等证据进行审查，以确定其非法经营同类营业的收入和支出情况。
• 通过计算净收入部分，即收入减去合理支出后的金额，来认定行为人获取的非法利益数额。
• 如果该数额达到法律规定的“数额巨大”标准，则行为人将构成非法经营同类营业罪，并依法受到刑事处罚。

我建议在涉及非法经营同类营业罪的案件中，应仔细审查行为人的财务记录和相关证据，以确保准确认定其非法利益数额，为案件的公正处理提供有力支持。如有进一步需要，您可以继续咨询我。