当被害人申请鉴定时，公安机关一般会按照以下程序进行处理：
接收申请：公安机关会首先接收被害人的鉴定申请，并了解申请的具体内容和要求。
初步审查：公安机关会对申请进行初步审查，包括审查申请是否符合相关法律规定，以及申请中提出的鉴定需求是否合理和必要。
决定是否受理：经过初步审查，如果认为申请符合规定且有必要进行鉴定，公安机关会决定受理申请，并告知被害人相关的鉴定程序和要求。如果认为申请不符合规定或无需鉴定，公安机关会向被害人说明理由，并告知其相应的法律后果。
委托鉴定机构：决定受理后，公安机关会委托具有相应鉴定资质的机构进行鉴定。在选择鉴定机构时，公安机关会确保其具备相应的专业能力和信誉。
进行鉴定：鉴定机构接受委托后，会按照相关程序和要求进行鉴定工作。这包括收集相关证据材料、进行必要的实验和分析，以及形成鉴定意见等。
出具鉴定意见：鉴定完成后，鉴定机构会出具鉴定意见，并送交给公安机关。公安机关会审查鉴定意见，确保其符合相关法律规定和程序要求。
告知被害人：最后，公安机关会将鉴定意见告知被害人，并根据鉴定结果依法进行后续处理。如果被害人对鉴定意见有异议，可以在规定期限内提出复议或重新鉴定的申请。
在整个过程中，公安机关会依法保障被害人的合法权益，确保鉴定程序的公正、公平和合法。如果您在这个过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。