合法证据法院有权不采纳，但这取决于多种因素。
证据关联性、合法性、真实性及完整性考量：
- 法院在审判过程中，会对证据的关联性、合法性、真实性以及完整性进行全面审查。即使证据合法，但若其与案件待证事实关联性不足、真实性存疑、形式上有瑕疵、证明力不够，或未能形成完整的证据链，法院都有可能不采纳该证据。
法官的自由裁量权：
- 在某些情况下，即使证据合法且相关，法官仍可能根据案件的具体情况，运用自由裁量权决定是否采纳该证据。例如，当存在多个相互矛盾的证据时，法官需根据证据证明力的大小进行取舍。
不采纳的合法性与救济途径：
- 若法官无故或违反法定程序不采纳合法证据，这可能构成违法。当事人可以通过上诉、申请再审或向检察院申请抗诉等法律途径来维护自己的合法权益。
实例说明：
- 假设在一起合同纠纷案件中，原告提交了一份合同原件作为证据，该证据合法且真实。但若被告提供了相反证据，证明该合同已被双方后续协议所修改或废止，且该后续协议同样合法有效，那么法院在综合考量后，可能不采纳原告提交的合同原件作为定案依据。
综上所述，合法证据并非必然被法院采纳，其采纳与否取决于证据的关联性、合法性、真实性、完整性以及法官的自由裁量权等多种因素。当事人应充分了解相关法律规定和诉讼程序，以便在必要时采取适当的救济措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。