危害珍贵、濒危野生动物犯罪案件的适用法律主要包括《中华人民共和国刑法》的相关规定。具体分析如下：

一. 主要法律依据

1. 《中华人民共和国刑法》第三百四十一条：非法猎捕、杀害国家重点保护的珍贵、濒危野生动物的，或者非法收购、运输、出售国家重点保护的珍贵、濒危野生动物及其制品的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节特别严重的，处十年以上有期徒刑，并处罚金或者没收财产。此条款明确规定了危害珍贵、濒危野生动物的基本刑罚。

2. 《中华人民共和国刑法》第三百四十一条还规定：违反狩猎法规，在禁猎区、禁猎期或者使用禁用的工具、方法进行狩猎，破坏野生动物资源，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者罚金。这一条款进一步规定了非法狩猎的刑罚，即使狩猎的对象不是珍贵、濒危野生动物，但如果破坏了野生动物资源，同样会受到法律的制裁。

3. 《中华人民共和国刑法》第三百四十一条第三款规定：违反野生动物保护管理法规，以食用为目的非法猎捕、收购、运输、出售第一款规定以外的在野外环境自然生长繁殖的陆生野生动物，情节严重的，依照前款的规定处罚。这一条款特别针对以食用为目的的非法猎捕、收购、运输、出售野生动物的行为，强调了法律对野生动物保护的全面性和严格性。

二. 法律适用要点

• 犯罪主体：包括非法猎捕、杀害、收购、运输、出售珍贵、濒危野生动物及其制品的个人或单位。
• 犯罪对象：国家重点保护的珍贵、濒危野生动物及其制品，以及以食用为目的非法猎捕、收购、运输、出售的在野外环境自然生长繁殖的陆生野生动物。
• 犯罪行为：非法猎捕、杀害、收购、运输、出售等行为均构成犯罪。
• 刑罚：根据犯罪的严重程度，分别处以五年以下有期徒刑或者拘役、五年以上十年以下有期徒刑、十年以上有期徒刑，并处罚金或者没收财产等刑罚。

综上所述，危害珍贵、濒危野生动物犯罪案件的适用法律主要是《中华人民共和国刑法》第三百四十一条的相关规定。在处理此类案件时，应严格依照法律规定，对犯罪行为进行准确认定，并依法予以惩处。如有进一步需要，您可以继续咨询我。