犯罪嫌疑人、被告人逃匿、死亡案件违法所得的没收程序是一个独立的特殊程序。该程序主要适用于贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等重大犯罪案件，在犯罪嫌疑人、被告人逃匿或死亡且符合一定条件下，对其违法所得及其他涉案财产进行没收。以下是对该程序的详细解析：
一. 适用范围
犯罪类型：该程序必须适用于贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等重大犯罪案件。这里的“贪污贿赂犯罪”是指由人民检察院立案侦查的刑法分则第八章规定的国家工作人员贪污罪和贿赂犯罪；“恐怖活动犯罪”是指实施恐怖活动的犯罪行为，包括刑法第一百二十条规定的组织、领导恐怖活动组织罪、第一百二十条之一规定的资助恐怖活动组织罪以及其他实施恐怖活动的犯罪。
逃匿或死亡条件：犯罪嫌疑人、被告人必须是逃匿后在通缉一年后不能到案的，或者犯罪嫌疑人、被告人死亡的。逃匿是指犯罪嫌疑人、被告人在犯罪后，为逃避法律制裁而逃跑、隐匿或躲藏。
二. 申请与审理
申请主体与材料：
- 人民检察院可以向人民法院提出没收违法所得的申请。公安机关认为有前款规定情形的，应当写出没收违法所得意见书，移送人民检察院。
- 没收违法所得的申请应当提供与犯罪事实、违法所得相关的证据材料，并列明财产的种类、数量、所在地及查封、扣押、冻结的情况。
审理程序：
- 人民法院受理没收违法所得的申请后，由犯罪地或者犯罪嫌疑人、被告人居住地的中级人民法院组成合议庭进行审理。
- 人民法院受理没收违法所得的申请后，应当发出公告。公告期间为六个月。犯罪嫌疑人、被告人的近亲属和其他利害关系人有权申请参加诉讼，也可以委托诉讼代理人参加诉讼。人民法院在公告期满后对没收违法所得的申请进行审理。利害关系人参加诉讼的，人民法院应当开庭审理。
三. 裁定与执行
裁定内容：
- 人民法院经审理，对经查证属于违法所得及其他涉案财产，除依法返还被害人的以外，应当裁定予以没收；对不属于应当追缴的财产的，应当裁定驳回申请，解除查封、扣押、冻结措施。
上诉与抗诉：
- 对于人民法院依照前款规定作出的裁定，犯罪嫌疑人、被告人的近亲属和其他利害关系人或者人民检察院可以提出上诉、抗诉。
四. 特别说明
- 缺席审判程序：对于贪污贿赂犯罪案件，以及需要及时进行审判，经最高人民检察院核准的严重危害国家安全犯罪、恐怖活动犯罪案件，犯罪嫌疑人、被告人在境外，且符合一定条件的，可以适用缺席审判程序。但这与违法所得没收程序是两个不同的程序，各有其适用条件和程序规定。
我建议相关方在涉及此类案件时，务必咨询专业律师以获取最准确的法律建议和指导。