扣章申请补贴是否会被抓，主要取决于该行为是否构成违法或犯罪。下面我将从几个角度来分析这个问题：
合法性角度：
- 如果扣章申请补贴的行为是在符合相关法律法规和政策规定的前提下进行的，比如你确实符合补贴申请的条件，且按照正规流程提交申请，那么这种行为是合法的，不会被抓。
- 反之，如果你通过扣章等不正当手段伪造申请材料或虚构事实来申请补贴，那么这种行为就可能构成违法，甚至犯罪，一旦被发现，就可能会面临法律责任。
行为性质角度：
- 扣章本身可能是一种违规行为，特别是如果这枚章是单位或组织的公章，未经授权擅自使用可能构成对单位或组织权益的侵害。
- 如果扣章行为是为了掩盖某些不法事实或进行欺诈，那么其性质就更加恶劣，不仅可能构成违法，还可能触犯刑法。
后果严重性角度：
- 如果扣章申请补贴的行为被查实，且造成了严重的后果，比如给国家、单位或他人造成了重大经济损失，那么行为人就可能面临严厉的处罚，包括但不限于罚款、拘留甚至刑事追责。
因此，我不能简单地回答你“扣章申请补贴会被抓”或“不会被抓”，这取决于具体的行为情况和后果。如果你正在考虑或已经进行了这样的行为，我建议你立即停止，并咨询专业律师以了解可能面临的法律风险和后果。如果你有任何法律上的疑问或需要进一步的帮助，请直接向我提问，我会尽力为你提供准确的法律解答和建议。