公司决议效力确认纠纷的被告主体通常是公司。以下是对此结论的详细分析：

一. 公司决议效力确认纠纷的被告主体

1. 依据法律规定：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司股东会、董事会的决议内容若违反法律、行政法规则无效。同时，若会议召集程序、表决方式违反法律、行政法规或者公司章程，或者决议内容违反公司章程，股东有权请求人民法院撤销。在这些情况下，诉讼的焦点在于公司决议的效力，因此公司自然成为被告主体。
2. 逻辑分析：在公司决议效力确认纠纷中，原告往往是认为决议存在违法或违规情形的股东。他们提起诉讼的目的是为了确认决议的效力，无论是无效还是可撤销。而决议是由公司作出的，因此公司应当作为被告来应对这一诉讼，解释决议的合法性或合理性。

二. 相关法律依据的进一步说明

• 《中华人民共和国公司法》第二十五条明确规定了公司股东会、董事会决议内容违反法律、行政法规的无效情形。
• 《中华人民共和国公司法》第二十六条则规定了股东在决议存在程序或内容违规时，有权请求人民法院撤销的情形。
• 《中华人民共和国公司法》第二十八条还规定了决议被宣告无效、撤销或确认不成立后的法律后果，即公司应向公司登记机关申请撤销根据该决议已办理的登记。

综上所述，在公司决议效力确认纠纷中，被告主体应当是公司。这是因为诉讼的核心在于确认公司决议的效力，而决议是由公司作出的，所以公司应当作为被告来参与诉讼。如有进一步需要，您可以继续咨询我。