要深入推进以证据为中心的刑事指控体系，需从多个方面着手，确保证据的合法性、客观性和关联性，以构建坚实、可靠的刑事指控基础。

一. 强化证据收集与保全

1. 依法收集证据：根据《刑事诉讼法》第五十条，审判人员、检察人员、侦查人员必须依照法定程序，收集能够证实犯罪嫌疑人、被告人有罪或者无罪、犯罪情节轻重的各种证据。这要求侦查机关在收集证据时，必须严格遵守法律程序，确保证据的合法性。
2. 全面、客观地收集证据：不仅要收集证明犯罪嫌疑人有罪的证据，也要收集可能证明其无罪的证据，以确保证据的客观性和全面性。
3. 及时保全证据：对于可能灭失或者以后难以取得的证据，应当及时进行保全，防止证据的丢失或损坏。

二. 加强证据审查与判断

1. 严格审查证据的真实性：在审查证据时，要仔细核对证据的来源、形成过程、存储方式等，确保证据的真实可靠。
2. 判断证据的关联性与证明力：要分析证据与案件事实之间的关联程度，以及证据对案件事实的证明力大小，确保指控体系建立在坚实、有力的证据基础之上。

三. 完善证据运用机制

1. 建立证据链：通过梳理、分析证据之间的内在联系，构建完整的证据链，以全面、系统地呈现案件事实。
2. 强化证据在庭审中的作用：在庭审过程中，要充分运用证据进行质证、辩论，确保法庭能够全面、客观地了解案件事实，并据此作出公正判决。

四. 提升侦查人员与检察人员的证据意识与能力

1. 加强培训与教育：通过定期举办培训、讲座等方式，提升侦查人员与检察人员的证据意识与收集、审查、运用证据的能力。
2. 鼓励实践与创新：鼓励侦查人员与检察人员在实践中不断探索、创新证据收集与运用的方法和技术，以适应不断变化的犯罪形势和司法需求。

我建议，在推进以证据为中心的刑事指控体系过程中，还应注重保障犯罪嫌疑人的合法权益，确保其在诉讼过程中的各项权利得到充分尊重和保护。同时，要加强与相关部门、机构的协作配合，形成工作合力，共同推动刑事指控体系的不断完善和发展。如有进一步需要，您可以继续咨询我。