假公证员公证的协议是无效的。下面我将从多个角度为您详细解释这一结论：

1. 公证员的合法性：

   • 公证员是依法取得公证员执业证书，在公证机构从事公证业务的执业人员。假公证员，即未取得合法公证员资格或未依法在公证机构执业的人员，其进行的所谓“公证”行为不具有法律效力。

2. 公证的效力来源：

   • 公证的效力主要来源于公证机构的公信力和公证程序的合法性。假公证员由于不具备合法的公证员身份，其所在机构也并非合法的公证机构，因此无法赋予协议以公证的法律效力。

3. 协议的有效性：

   • 协议的有效性主要取决于协议内容是否合法、双方意思表示是否真实以及是否违反法律强制性规定。然而，即使协议内容本身没有问题，如果是由假公证员进行“公证”，那么这份“公证”协议也是无效的，因为它缺乏合法的公证程序和法律效力来源。

4. 法律后果：

   • 如果当事人依据假公证员公证的协议进行交易或履行义务，可能会面临法律风险。一旦发生纠纷，法院或仲裁机构可能会认定该协议无效，导致当事人的权益无法得到保障。

综上所述，假公证员公证的协议是无效的。因此，在签订协议并希望进行公证时，务必确保选择合法的公证机构和具有合法资格的公证员进行公证。如果您对此类问题有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。