章程规定半数以上股东同意不违反新公司法。以下是对这一问题的详细分析：
一. 新公司法关于股东会决议的规定
根据新版《公司法》第六十六条第二款的规定，股东会作出决议时，必须经代表过半数表决权的股东通过。这一规定明确了股东会决议的通过比例，取代了旧版公司法中由公司章程自行约定的灵活性。
二. 公司章程与公司法的关系
设立公司章程的要求：
- 根据《公司法》第四十五条和第九十四条，设立有限责任公司应由股东共同制定公司章程；设立股份有限公司则需发起人共同制定公司章程。这意味着新设立的公司章程必须体现全体股东的意志。
公司章程的自治性：
- 虽然公司法对公司治理结构和股东决策过程有了一系列明确规定，但公司章程仍然具有一定的自治性。例如，对于某些特殊事项，公司章程可以做出与公司法不同的规定，只要这些规定不违反法律的强制性规范。
三. 章程规定半数以上股东同意的合法性
符合公司法精神：
- 章程规定半数以上股东同意，实际上是符合公司法关于股东会决议通过比例的精神的。因为公司法已经明确要求股东会决议需过半数表决权通过，而章程规定半数以上股东同意并不低于这一比例要求。
未违反法律强制性规范：
- 在没有违反法律强制性规范的前提下，公司章程可以对某些事项做出更为详细或具体的规定。因此，只要章程规定半数以上股东同意的事项不属于公司法规定的必须经代表三分之二以上表决权通过的特殊事项（如修改公司章程、增加或减少注册资本等），那么这一规定就是合法的。
四. 结论与建议
结论：
- 综上所述，章程规定半数以上股东同意并不违反新公司法。这一规定既符合公司法关于股东会决议通过比例的精神，又未违反法律的强制性规范。
建议：
- 在制定或修改公司章程时，企业应确保相关规定既符合公司法的精神，又能够体现全体股东的意志和利益。如有需要，可以寻求专业律师的帮助以确保公司章程的合法性和有效性。
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