客户把库存材料转让给工厂是否合法，需要根据具体情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：

一. 库存材料转让的合法性基础

1. 存货人权利：根据《中华人民共和国民法典》第九百一十条，仓单是提取仓储物的凭证。存货人或者仓单持有人在仓单上背书并经保管人签名或者盖章的，可以转让提取仓储物的权利。这表明，在符合法律规定的情况下，存货人（即客户）有权转让其库存材料。

2. 合同合法性：存货人转让提取仓储物的权利时，需要确保仓储合同合法存在，且仓单有效。同时，存货人还需在仓单上背书转让，并由保管人签名或盖章确认。

二. 库存材料转让的具体考量

1. 公司经营范围：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的经营范围应当在营业执照上明确载明。若库存材料属于公司经营范围内的物品，公司有权对其进行合法处理，包括转让给工厂。

2. 公司内部规定：若公司章程或股东会决议等内部文件对公司财产的处理有特别规定，客户在转让库存材料时应当遵循这些规定。

3. 税务处理：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》的相关规定，若库存材料的转让属于销售行为，应当依法缴纳增值税；若属于委托加工行为，则需要注意进项税额的抵扣问题。

三. 特殊情况与限制

1. 加工贸易货物监管：若库存材料涉及加工贸易货物，根据加工贸易货物监管办法，这些货物应当专料专用，且未经海关核准，不得擅自转让。因此，在转让此类库存材料时，需要特别注意海关的监管要求。

2. 特许经营权限制：若库存材料涉及特许经营权，如某些特定品牌或技术的使用权，则未经特许人同意，被特许人（即客户）不得擅自转让这些库存材料。

四. 结论与建议

1. 结论：综上所述，客户把库存材料转让给工厂在一般情况下是合法的，但具体是否合法还需根据库存材料的性质、公司的经营范围、内部规定以及税务处理等因素综合判断。若库存材料涉及加工贸易货物或特许经营权等特殊情况，则可能需要额外的审批或许可。

2. 建议：在进行库存材料转让前，客户应当仔细审查相关法律法规及公司规定，确保转让行为的合法性。如有必要，建议咨询专业律师或税务师以获取更准确的法律意见和税务筹划建议。

• 例如，若客户计划转让一批涉及加工贸易的库存材料给工厂，应先向海关咨询并获得核准，以确保转让行为的合法性。