通过车牌号直接扣费，在未经车主同意的情况下，可能构成违法行为。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》第一千零三十四条：自然人的个人信息受法律保护。个人信息是以电子或者其他方式记录的能够单独或者与其他信息结合识别特定自然人的各种信息，包括自然人的姓名、出生日期、身份证件号码、生物识别信息、住址、电话号码、电子邮箱、健康信息、行踪信息等。车牌号作为车辆的重要识别信息，与车主的个人隐私紧密相关，受法律保护。

2. 《中华人民共和国民法典》第一千零三十五条：处理个人信息的，应当遵循合法、正当、必要原则，公开处理信息的规则，明示处理信息的目的、方式和范围，并经个人同意，但是法律、行政法规另有规定的除外。未经车主同意，擅自通过车牌号进行扣费，可能违反了这一原则。

二. 行为分析

• 如果通过车牌号直接扣费的行为是在车主明确同意，并且相关扣费信息透明、合法的情况下进行的，那么这种行为可能不构成违法。
• 然而，在未经车主同意或未明确告知车主的情况下，通过车牌号直接扣费，就可能侵犯了车主的个人信息权益，构成违法行为。

三. 结论与建议

• 结论：因此，通过车牌号直接扣费，在未经车主同意的情况下，可能构成对车主个人信息权益的侵犯，从而构成违法行为。
• 建议：对于任何涉及个人信息处理的行为，都应遵循合法、正当、必要的原则，并确保经过个人同意。车主也应保护好自己的个人信息，避免被不法分子利用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。