车管所无法直接消除因员工驾驶公司车辆产生的违章扣分。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 违章扣分的责任归属

1. 驾驶员责任：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，违章行为的责任通常由驾驶员承担。无论是公司的车还是私人的车，一旦违章，扣分和罚款都会记录在驾驶员的驾驶证上。
2. 公司无法替代责任：公司作为车辆的所有者，并不能替代驾驶员承担违章扣分的责任。因此，即使员工离职，公司也不能要求车管所消除其在职期间因驾驶公司车辆产生的违章扣分。

二. 离职后违章扣分的处理

1. 离职不影响责任：员工离职后，其在职期间产生的违章扣分仍然有效，不会因为离职而自动消除。
2. 需要驾驶员自行处理：驾驶员需要按照交通管理部门的规定，按时处理违章扣分和罚款，以免影响自己的驾驶证状态和信用记录。

三. 车管所的职能

1. 管理交通事务：车管所主要负责车辆注册、年检、驾驶证申领等交通管理事务。
2. 无权消除违章扣分：车管所并没有权力直接消除驾驶员的违章扣分。违章扣分的处理需要按照交通管理部门的程序进行，驾驶员需要自行前往交通管理部门处理。

综上所述，车管所无法直接消除因员工驾驶公司车辆产生的违章扣分。员工离职后，其在职期间产生的违章扣分仍然需要驾驶员自行处理。我建议公司加强与员工的沟通和管理，确保员工在离职前妥善处理所有违章事宜，以避免不必要的麻烦和损失。如有进一步需要，您可以继续咨询我。