医生从主要执业机构离职后，其在该机构的多机构备案自动失效。下面我对此进行详细分析：

一. 医师执业注册与备案的基本规定

1. 主要执业机构与备案机构：根据《医师执业注册管理办法》及相关规定，医师需确定一个机构作为主要执业机构，并向批准该机构执业的卫生计生行政部门申请注册。对于拟执业的其他机构，则需向相应卫生计生行政部门申请备案。

2. 备案的有效性与执业机构关联：医师的执业范围应与备案的医疗机构诊疗科目相符，且备案是基于医师与特定医疗机构的执业关系而存在的。

二. 离职对多机构备案的影响

1. 离职导致备案失效：当医师从其主要执业机构离职时，其与该机构的执业关系即告终止。由于多机构备案是建立在这种执业关系之上的，因此离职自然导致在该机构的多机构备案失效。

2. 重新注册或备案的必要性：若医师希望在其他机构继续执业，需按照相关规定重新申请注册或备案，以确保其执业活动的合法性和有效性。

• 例如，张医生原在A医院注册为主要执业机构，并在B医院进行了多机构备案。若张医生从A医院离职，其在B医院的多机构备案将自动失效。若张医生希望在B医院继续执业，需重新向B医院所在地的卫生计生行政部门申请备案。

综上所述，医生从主要执业机构离职后，其在该机构的多机构备案将自动失效。因此，建议医师在离职前或离职后，及时关注并处理自己的执业注册和备案问题，以确保执业活动的合法性和有效性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。