在法院阶段不认罪认罚，法院将依据全部案卷中的证据以及客观事实来断定被告方是否真正有罪，并可能作出有罪判决。同时，被告人可能会错失获得从宽处罚的机会。具体分析如下：

一. 法院将依据证据和事实判断有罪

在庭审过程中，若被告人选择不认罪认罚，法院不会因此直接作出有罪或无罪的判决。相反，法院会全面、细致地审查所有提交的证据，包括侦查阶段收集的证据、庭审中的质证等，以确保判决的公正性和准确性。若证据确实充分，足以认定犯罪事实，法院会依法作出有罪判决。

• 例如，一起盗窃案中，若被告人不认罪认罚，但现场监控视频、证人证言等证据均指向其为犯罪嫌疑人，且证据之间形成了完整的证据链，那么法院在全面审查后，仍可能依法作出有罪判决。

二. 可能错失从宽处罚的机会

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十五条的规定，犯罪嫌疑人、被告人自愿如实供述自己的罪行，承认指控的犯罪事实，愿意接受处罚的，可以依法从宽处理。因此，若被告人在法院阶段选择不认罪认罚，就可能错失这一从宽处罚的机会。

• 例如，在一起轻微的刑事案件中，若被告人选择认罪认罚，可能只需要承担较轻的刑罚，甚至可能获得缓刑。但若其选择不认罪认罚，法院在量刑时可能不会充分考虑认罪认罚从宽情节，从而作出相对较重的判决。

三. 最终判决需综合考量

需要强调的是，即便被告人在法院阶段不认罪认罚，法院也不会仅凭此一点就作出有罪或无罪的判决。法院会综合考虑案件的所有情况，包括证据的真实性、充分性，被告人的犯罪情节、主观恶性，以及社会危害程度等因素，来作出公正、合理的判决。

综上所述，在法院阶段不认罪认罚，可能会影响被告人的量刑情节考量，但并不会直接决定案件的判决结果。法院会依据证据和事实来作出公正、合理的判决。同时，我也建议被告人在面对刑事诉讼时，应充分了解自己的权利和义务，理性选择认罪认罚与否，以争取更好的法律结果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。