部队自主择业干部被判刑，其待遇确实会受到影响。具体分析如下：

一. 自主择业军队转业干部受刑事处罚后的待遇问题

1. 停止享受自主择业待遇的情形：

   • 根据《关于自主择业军队转业干部受刑事处罚后有关待遇问题的通知》（国转联[2014]8号文件），自主择业军队转业干部受刑事处罚（不含单处附加刑）的，从判决发生法律效力之日起停止享受自主择业军队转业干部待遇。

2. 特殊情形下的生活费发放：

   • 被判处管制或者判处拘役、有期徒刑宣告缓刑的，在管制和缓刑执行期间，按本人退役金中相关组成部分的数额之和发给生活费。

3. 刑罚执行完毕后的待遇：

   • 犯危害国家安全罪或被判处五年有期徒刑以上刑罚的，刑罚执行完毕后不再享受自主择业军队转业干部待遇。
   • 除上述情形外，其他自主择业军队转业干部刑满释放后，可享受自主择业军队转业干部待遇，但根据罪行的轻重和服刑期间的表现，会按照降低一至两职重新核定退役金和各项生活待遇标准。

二. 具体执行规定

• 刑期的界定以终审宣判刑期为准，服刑期间又犯新罪或发现漏罪等被加刑的，也按照最终宣判的刑期为准。
• 受刑事处罚期间，停止退役金年定期增资和退役金调整。服刑结束后继续享受待遇的，从刑满释放当年开始进行年定期增资并执行调整后的退役金标准。

我的观点：部队自主择业干部被判刑后，其待遇会依据刑罚的轻重和性质受到不同程度的影响。因此，建议自主择业军队转业干部在退役后应严格遵守法律法规，维护个人和社会的和谐稳定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。