自主择业干部判刑5年，其退役金会被停发。具体分析如下：

一. 自主择业干部判刑后的退役金处理

1. 依据规定：根据《军队转业干部安置暂行办法》等相关规定，自主择业的军队转业干部，被判处有期徒刑以上刑罚的，自判决生效之日起，停止享受自主择业军队转业干部待遇。

2. 实际执行：在实际操作中，一旦自主择业干部被判处有期徒刑，如5年，其退役金将立即停发，直至刑罚执行完毕。

• 例如，某自主择业干部因犯罪被判刑5年，那么从判决生效的那一刻起，他的退役金就会被停发，直到他服刑结束。

二. 总结

综上所述，自主择业干部若被判刑5年，其退役金确实会被停发。这是基于相关规定和实际执行情况的明确结论。我建议您，如果面临此类情况或对此有更多疑问，可以进一步了解相关法律法规，或咨询相关部门以获取更详细的信息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。