若老厂房院内原本的土地用途并非农田，且未经合法程序擅自改变土地用途种玉米，这可能违反了土地管理法规，应依法恢复原状并可能面临处罚。具体分析如下：

一. 改变土地用途的合法性分析

1. 土地用途的法定性：根据《中华人民共和国土地管理法》第四条，国家实行土地用途管制制度，将土地分为农用地、建设用地和未利用地。严格限制农用地转为建设用地，控制建设用地总量，对耕地实行特殊保护。因此，土地用途的改变必须依法进行，不得擅自改变。
2. 改变土地用途的程序：若确需改变土地用途，应依据《中华人民共和国土地管理法》第五十六条的规定，建设单位使用国有土地的，应当按照土地使用权出让等有偿使用合同的约定或者土地使用权划拨批准文件的规定使用土地；确需改变该幅土地建设用途的，应当经有关人民政府自然资源主管部门同意，报原批准用地的人民政府批准。

二. 擅自改变土地用途的法律后果

1. 恢复原状与处罚：根据《中华人民共和国土地管理法》第七十四条，买卖或者以其他形式非法转让土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门没收违法所得；对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法转让的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，对符合土地利用总体规划的，没收在非法转让的土地上新建的建筑物和其他设施；可以并处罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。虽然此条款针对的是非法转让土地的行为，但擅自改变土地用途同样可能面临类似的法律后果，即恢复原状并可能受到罚款等处罚。
2. 实际操作的建议：首先，应确认老厂房院内土地的原始用途和是否经过合法程序改变用途。若确实存在擅自改变土地用途的情况，建议立即停止违法行为，并主动向当地自然资源主管部门报告，寻求合法的解决方案。

三. 总结与建议

• 总结：擅自改变土地用途是违法的，可能面临法律处罚和恢复原状的要求。
• 建议：若您是老厂房的负责人或相关利益方，应尽快核实土地用途的合法性，并咨询当地自然资源主管部门，了解如何合法地调整土地用途或恢复原状。如有进一步需要，您可以继续咨询我。