核心结论：针对以前建设的化粪池现在被改为基本农田的情况，需要分步骤处理，包括确认土地性质变更的合法性、与相关部门沟通协商、寻求法律救济途径等。以下是具体分析：

1. 确认土地性质变更的合法性

   • 调查背景：首先，需要了解该化粪池所在土地原本的性质（如是否为建设用地、未利用地等），以及变更土地性质为基本农田的具体依据和程序。这通常涉及查阅当地的土地利用总体规划、城乡规划以及相关政府部门的批复文件。
   • 合法性评估：根据《土地管理法》等相关法律法规，基本农田的划定和调整需经过严格的程序，并报国务院批准。如果土地性质变更未经合法程序，则可能构成违法行为。

2. 与相关部门沟通协商

   • 联系当地自然资源部门：一旦发现土地性质变更可能存在问题，应首先联系当地的自然资源部门（原国土资源部门），了解变更的具体原因和依据，并表达你的关切和疑问。
   • 提出异议或申请复核：如果认为土地性质变更不合法或存在争议，可以向相关部门提出异议，并申请对土地性质进行复核。在提出异议时，应提供充分的证据和理由支持你的观点。

3. 寻求法律救济途径

   • 行政复议：如果对相关部门的处理结果不满意，可以在法定期限内向上一级行政机关申请行政复议。行政复议是一种行政救济方式，旨在纠正违法的或不当的行政行为。
   • 行政诉讼：如果行政复议未能解决问题，或者认为相关部门的行政行为严重侵犯了你的合法权益，可以向人民法院提起行政诉讼。在行政诉讼中，法院将对行政行为的合法性进行审查，并作出判决。

4. 考虑实际影响与补偿

   • 评估影响：除了关注土地性质变更的合法性外，还应评估这一变更对你实际使用土地的影响。例如，如果化粪池被拆除或迁移，可能会对你的生产生活造成不便或损失。
   • 寻求补偿：如果土地性质变更导致你遭受了实际损失，且这一变更是违法的或未经你同意的，你可以考虑向相关部门寻求补偿。补偿的具体方式和标准可能因地区而异，需根据当地法律法规和政策来确定。

行动建议：

• 尽快收集与该化粪池及土地性质变更相关的所有文件和证据，包括土地使用证、建设许可证、政府批复文件等。
• 咨询专业人士（如我，一名多领域法律实务经验的律师）以获取更具体的法律建议和指导。
• 根据实际情况选择合适的法律救济途径，并积极准备相关材料和证据以支持你的主张。