非农业用地被改为基本农田属于违法行为，必须恢复原状并接受行政处罚，若涉及犯罪还需承担刑事责任。以下是详细分析：

1. 法律定性
   根据《土地管理法》第三十五条，基本农田必须经国务院批准方可调整，任何单位或个人不得擅自占用或改变用途。非农业用地（如建设用地、未利用地）未经法定程序转为基本农田，属于非法占用土地行为，违反《土地管理法》第七十七条。

2. 行政处理措施

   • 责令恢复原状：县级以上自然资源主管部门可要求违法者限期拆除地上建筑物、恢复土地原用途（如复垦为非农用地）。
     
   • 罚款：按非法占用土地面积处以每平方米100元以上1000元以下罚款（《土地管理法实施条例》第五十七条）。
     
   • 没收违法所得：若违法者通过改变用途获利（如出租、转让），需没收违法所得。

3. 刑事责任风险
   若非法占用基本农田面积达到5亩以上，或造成耕地大量毁坏（如硬化、污染），可能触犯《刑法》第三百四十二条【非法占用农用地罪】，处五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金。

4. 特殊情形处理

   • 历史遗留问题：若改变用途行为发生在2019年《土地管理法》修订前，可能适用旧法条款，但仍需补办合法手续或恢复原状。
     
   • 政府主导项目：若涉及公共利益（如交通、水利），需通过土地征收程序将非农用地转为建设用地，再依法调整基本农田布局，严禁直接“以调代征”。

建议行动：

1. 立即停止违法行为，避免扩大损失；
   
2. 委托律师评估土地现状、违法情节及行政处罚风险；
   
3. 若涉及刑事犯罪，争取自首、立功等从轻情节；
   
4. 通过合法途径申请土地用途变更（如编制国土空间规划调整方案）。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。