已经和银行协商也按时还款，一般能开非恶意逾期证明。以下是对此问题的详细分析：

一、非恶意逾期证明的开具条件

非恶意逾期证明是银行为证明借款人非因恶意原因导致的逾期还款而出具的一种证明。通常，在以下情况下，银行可能会考虑开具非恶意逾期证明：

1. 借款人已与银行协商：借款人已与银行就逾期还款事宜进行了协商，并达成了新的还款协议或安排。这表明借款人具有积极解决逾期问题的态度，且银行对借款人的还款能力或意愿表示了一定的认可。
2. 借款人已按时还款：在协商后，借款人按照新的还款协议或安排，按时履行了还款义务。这进一步证明了借款人的还款能力和诚信度。

二、开具非恶意逾期证明的流程

1. 联系银行：借款人应主动联系银行，说明自己的实际情况和开具非恶意逾期证明的需求。
2. 提供证明材料：借款人可能需要提供相关的证明材料，如还款记录、协商协议等，以证明自己的逾期还款行为是非恶意的。
3. 等待银行审核：银行会对借款人的申请进行审核，并根据借款人的实际情况和银行政策决定是否开具非恶意逾期证明。

三、注意事项

1. 诚信为本：无论是在协商还款还是申请开具非恶意逾期证明时，借款人都应保持诚信，如实提供相关信息和证明材料。
2. 了解银行政策：不同银行对于开具非恶意逾期证明的政策可能有所不同，借款人应提前了解并遵循相关政策和流程。
3. 妥善保管证明：一旦开具了非恶意逾期证明，借款人应妥善保管该证明，以备后续使用或查询。

综上所述，如果你已经与银行协商并按时还款，那么你有权向银行申请开具非恶意逾期证明。在申请时，请务必保持诚信、了解银行政策并妥善保管相关证明。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。