事业单位合同工辞职，应提前与单位协商或依据法定情形单方面解除劳动合同，并注意办理离职手续及经济补偿等事项。具体分析如下：

一. 辞职流程

1. 协商解除：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。因此，事业单位合同工可以与单位协商，达成一致后解除劳动合同。

2. 法定情形解除：依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条，若用人单位存在未按照劳动合同约定提供劳动保护或劳动条件、未及时足额支付劳动报酬等情形，劳动者可以单方面解除劳动合同。事业单位合同工在遭遇这些情形时，也有权依法解除劳动合同。

3. 通知单位：无论协商解除还是法定情形解除，劳动者都应提前通知用人单位，并按照单位的要求办理离职手续。

二. 注意事项

1. 经济补偿：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条，若劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同，用人单位应向劳动者支付经济补偿。事业单位合同工在辞职时，如符合经济补偿条件，应依法向单位主张经济补偿。

2. 离职手续：辞职时，劳动者应按照单位的要求办理离职手续，包括但不限于工作交接、财务结算等。确保离职手续办理完毕，以免留下不必要的麻烦。

3. 保留证据：在辞职过程中，劳动者应保留好与单位的沟通记录、离职手续办理凭证等证据，以备不时之需。

• 例如，若事业单位合同工因单位未及时足额支付劳动报酬而辞职，应保留好工资单、银行流水等证据，以便在主张经济补偿时提供证明。

我建议事业单位合同工在辞职前，应充分了解自己的权益和义务，确保辞职过程合法合规。如有进一步需要，您可以继续咨询我。