公司主张股东支付款项的管辖地可以是在公司注册地。但具体还需根据实际情况，结合相关法律法规来确定。下面我为您详细分析：

1. 一般管辖原则：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
   • 在公司主张股东支付款项的纠纷中，如果双方没有约定管辖地，那么原则上可以由被告（即股东）住所地或者合同履行地（可能是公司注册地，也可能是其他与合同履行相关的地点）的人民法院管辖。

2. 公司注册地作为管辖地的特殊情况：

   • 如果公司注册地与合同履行地重合，或者双方在公司章程、合同等文件中明确约定了由公司注册地法院管辖，那么公司注册地法院就有权受理此类纠纷。
   • 此外，如果股东与公司之间存在某种特定的法律关系（如股东协议、投资协议等），并且这些协议中约定了由公司注册地法院管辖，那么同样可以依据这些协议来确定管辖地。

3. 其他考虑因素：

   • 在确定管辖地时，还需要考虑实际操作的便利性、法院的专业性、诉讼成本等因素。
   • 如果股东遍布全国各地，选择公司注册地法院可能更有利于集中管辖，提高诉讼效率。

综上所述，公司主张股东支付款项的管辖地可以是在公司注册地，但具体还需根据双方约定、合同履行地以及相关法律法规来确定。如果您在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。