商业秘密刑事案件中的被侵权人可以委托司法鉴定机构对电子数据进行同一性鉴定。

在商业秘密纠纷中，同一性鉴定是判断被诉侵权方的技术信息、经营信息与权利人构成密点的信息是否相同或实质性相同的重要鉴定类型。这一鉴定过程通常由第三方鉴定机构进行，以确保鉴定的公正性和准确性。在商业秘密刑事案件中，电子数据作为证据的形式越来越常见，而同一性鉴定则是确认这些电子数据是否与侵权行为相关、是否构成商业秘密的关键步骤。

因此，如果商业秘密的刑事案件中涉及到电子数据作为证据，且需要确认这些电子数据是否与权利人的商业秘密相同或实质性相同，被侵权人完全有权委托司法鉴定机构进行同一性鉴定。这一鉴定结果将对于案件的审理和判决具有重要的参考价值。

如果你在此类案件中遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问，我会尽我所能为你提供帮助。