法院在受理案件时，若发现动迁存在违法行为，会依据相关法律法规进行如下处理：

1. 审查与确认：

   • 法院会首先对动迁行为的合法性进行全面审查，包括动迁的依据、程序、补偿标准等方面。
   • 若发现确实存在违法行为，如未经批准擅自动迁、未按照法定程序进行动迁、补偿标准不符合规定等，法院会依法予以确认。

2. 撤销或纠正：

   • 对于违法的动迁行为，法院有权依法撤销或责令相关机关予以纠正。
   • 这意味着，如果动迁行为被认定为违法，那么该行为自始无效，相关当事人有权要求恢复原状或获得相应的补偿。

3. 赔偿或补偿：

   • 因违法动迁行为给当事人造成损失的，法院会依法判决相关责任主体承担赔偿责任。
   • 赔偿责任包括但不限于直接经济损失、间接经济损失以及因动迁行为导致的其他合理损失。

4. 追究法律责任：

   • 对于在动迁过程中存在违法行为的个人或单位，法院会依法追究其法律责任。
   • 这可能包括行政责任、刑事责任等，具体根据违法行为的性质和情节而定。

5. 监督与执行：

   • 法院在作出判决后，会监督相关责任主体履行判决内容，确保当事人的合法权益得到有效保障。
   • 若相关责任主体拒不履行判决，法院有权采取多种强制措施予以执行。

综上所述，法院在受理案件时发现动迁有违法行为，会依法进行审查、确认、撤销或纠正，并判决相关责任主体承担赔偿责任，同时追究其法律责任。若您在此类问题中遇到困难或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。